Coronavirus SARS-CoV-2: Nachweissysteme und Assay-Entwicklung

Das Auftreten neuer Viruskrankheiten, darunter die Coronaviren SARS-CoV-2 (COVID 19), MERS (2015) und SARS (2003), unterstreicht die Notwendigkeit für schnelle und zuverlässige Methoden zur Identifizierung und zum Nachweis der Zielviren in großem Maßstab. Die SARS-CoV-2 Pandemie veranschaulicht auch, wie Forschungsbemühungen zur Entwicklung von Arzneimitteln und Impfstoffen in Zeiten dringenden Bedarfs beschleunigt werden. Die Eindämmung der SARS-CoV-2 Pandemie erfordert eine unmittelbare Unterstützung der Wissenschaft mit Forschungsreagenzien und Testsystemen.

Promega unterstützt Wissenschaftler, die Nachweismethoden entwickeln und Grundlagenforschung betreiben, um die molekularen Mechanismen des SARS-CoV-2 Virus zu verstehen. Unsere Mitarbeiter stehen hierbei den Forschern beratend zur Seite und teilen gerne ihr methodisches und technisches Wissen aus den Bereichen der Nukleinsäure-Aufreinigung und -Amplifikation, sowie der Reportertechnologien.

Amplifikationsprodukte für virale Analysen

qPCR und RT-qPCR

PCR-Reagenzien, einschließlich qPCR- und RT-qPCR, werden zum Nachweis und zur Amplifikation von viralen Zielsequenzen verwendet. Diese Reagenzien sind in virologischen Forschungsstudien weit verbreitet. Das Center for Disease Control and Prevention (CDC) empfiehlt das GoTaq® Probe 1-Step RT-qPCR System als Master Mix im 2019-Novel Coronavirus Real-Time RT-PCR Diagnostic Panel.

PCR Reagenzien und Zubehör

Referenzen

RT-PCR:

Diagne, M. et al. (2020) Dianke virus: A new mesonivirus species isolated from mosquitoes in Eastern Senegal. Virus Research 275, 2 January 2020, 197802.

Alves, M.T. et al. (2018) Mamastrovirus 5 detected in a crab-eating fox (Cerdocyon thous): Expanding wildlife host range of astroviruses. Comparative Immunology, Microbiology and Infectious Diseases 58, 36-43.

qPCR für den Nachweis viraler RNA:

Cai, M. et al. (2020) The R251K Substitution in Viral Protein PB2 Increases Viral Replication and Pathogenicity of Eurasian Avian-like H1N1 Swine Influenza Viruses. Viruses 12(1), 52.

Virale Strukturen und Charakterisierung:

Wicht, O. et al. (2014) Proteolytic Activation of the Porcine Epidemic Diarrhea Coronavirus Spike Fusion Protein by Trypsin in Cell Culture. J. Virol. 88(14), 7952–7961.


Skalierbare Aufreinigungsmethoden für virale Nukleinsäuren

Bewährte Chemie von Promega für die virale Nukleinsäureaufreinigung ist in manuellen bis hin zu automatisierten Verfahren im Bench-Top- oder im High-Throughput- (HT-) Format erhältlich und bietet für jeden Durchsatz die passende Lösung. 

Neben den Maxwell® Systemen für die automatisierte Nukleinsäure-Aufreinigung von bis zu 48 Proben in vorgefüllten Kartuschen, gibt es auch HT-Kits für den Hochdurchsatz im 96-Well- oder 384-Well-Format, die mit allen marktüblichen Automationsplattformen kompatibel sind. Zusätzlich bietet Promega eine Vielzahl an Applikationsprotokollen für die manuelle Aufreinigung viraler Nukleinsäuren an. Damit kann eine Vielzahl an Forschungslaboren, die an der Entwicklung von SARS-CoV-2-Nachweistests und an der Erforschung von Lösungen für die COVID-19-Pandemien beteiligt sind, passend zu Ihren Anforderungen unterstützt werden.


Automatisierte Aufreinigung viraler Nukleinsäuren

Maxwell® Geräte in Kombination mit Maxwell® RSC Viral Total Nucleid Acid Purifikation Kits extrahieren virale Nukleinsäuren von bis zu 48 Proben in einem Lauf.

Maxwell instruments automate purification of viral nucleic acids

Reagenzien für die manuelle und automatisierte Hochdurchsatz Nukleinsäure-Aufreinigung

Maxwell® HT Viral TNA Kit, Custom

Das Maxwell® HT Viral TNA Kit verwendet paramagnetische Partikel zur einfachen, automatisierten Aufreinigung mit allen marktüblichen Automationsplattformen. Exemplarische Protokolle gibt es für Tecan-, Hamilton-, Eppendorf- und Thermofisher-Automationsplattformen. Das Maxwell® HT Viral TNA Kit kann auch für die manuelle Aufreinigung in Multiwell-Platten verwendet werden. Entsprechende Applikationsprotokolle finden Sie weiter unten auf dieser Seite. 

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ReliaPrep™ Viral TNA Miniprep Kit, Custom

Das säulenbasierte ReliaPrep™ Viral TNA Miniprep Kit ist als Custom-Produkt erhältlich und bietet eine schnelle Bearbeitung von Virus-Proben mit Hilfe eines zentrifugationsbasierten Protokolls. Anwendungsbeispiele finden Sie unten in den Application Notes.

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Automatisieren und Optimieren mit Experten

Unsere Experten unterstützen Sie gern bei der Hochdurchsatz-Automatisierung viraler RNA-Extraktionsmethoden in Ihrem Labor – Unabhängig von Ihrer Automationsplattform.

Sie haben noch keine Erfahrung mit der Hochdurchsatz-Automatisierung oder brauchen Hilfe bei der Auswahl und Anpassung geeigneter Aufreinigungs-Methoden für virale Nukleinsäuren? Promega unterstützt Sie und arbeitet mit Ihnen zusammen, um Ihr Gerät zu konfigurieren und den Arbeitsablauf entsprechend Ihren Anforderungen zu optimieren.

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Referenzen

Extraktion viraler RNA mit Hilfe von Maxwell® 48:

Jaeger, A.S. et al. (2018) Zika viruses of both African and Asian lineages cause fetal harm in a vertical transmission model. PLOS Neglected Tropical Diseases doi: 10.1371/journal. pntd.0007343

Chantal Reusken, C. et al. (2019) Toscana, West Nile, Usutu and tick-borne encephalitis viruses: external quality assessment for molecular detection of emerging neurotropic viruses in Europe, 2017. Euro Surveill. Dec 12; 24(50): 1900051.

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Wir möchten unsere Kunden in der Diagnostik und Forschung unterstützen. Denn nur mit vereinten Kräften können wir diese Pandemie besiegen.

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Reportertechnologien für die Virologie

Luciferase Reporter

Luciferase Reporter eignen sich hervorragend für Wirkstoffscreenings, Untersuchung von Virus-Zell-Interaktionen, Etablierung von in vitro Tests zum Nachweis viraler Antikörper und für das Imaging von Viren in Tiermodellen. Für die Virusforschung eignen sich sowohl die Firefly-Luciferase als auch die NanoLuc®-Luciferase. Die NanoLuc®-Luciferase ist aufgrund ihrer geringen und kompakten Größe insbesondere für die Erstellung von Reporterviren geeignet. Darüber hinaus überzeugt sie durch eine sehr hohe Nachweisempfindlichkeit.

Remdesivir (RDV or GS-5734) wurde zur Behandlung des ersten Falls von SARS-CoV-2 (ehemals 2019-nCoV) in den USA eingesetzt. RDV wurde bisher in keinem Land als Medikament zugelassen, doch seine Nachfrage bei den Behörden zur Behandlung der COVID-19-Patienten steigt weltweit an. Erfahren Sie mehr über die Applikationen der Luciferase-Reporter in der Forschung.

Referenzen

Evaluation der potenziell anti-viralen Wirkstoffe:

Zhang, L. et al. (2020) Alpha-ketoamides as broadspectrum inhibitors of coronavirus and enterovirus replication. Structure-based design, synthesis, and activity assessment. J. Med Chem. DOI: 10.1021/ acs.jmedchem.9b01828. Publication Date (Web): 11 Feb 2020

Sheahan, T.P et al. (2020) Comparative therapeutic efficacy of remdesivir and combination lopinavir, ritonavir, and interferon beta against MERS-CoV. Nature Communications 11, Article number: 222.

Nachweis von viralen Antikörpern im Serum mittels NanoLuc®-Luciferase:

Wang, W. et al. (2019) A novel luciferase immunosorbent assay performs better than a commercial enzyme-linked immunosorbent assay to detect MERS-CoV specific IgG in humans and animals. Biosafety and Health 1(3), 134-143.

Biolumineszentes Imaging der Viren:

Shen, L. et al. (2019) High-Throughput Screening and Identification of Potent Broad-Spectrum Inhibitors of Coronaviruses. DOI: 10.1128/ JVI.00023-19. J. Virol93(12), e00023-19.

SARS-CoV-2 Forschung, Impfstoff und therapeutische Entwicklung

Reporter- und Zellviabilitätsassays, RT-qPCR und RNA-Produktionssysteme werden von Forschern für die Untersuchung der viralen Pathogenese zunehmend eingesetzt. Dazu gehören unter anderem das Tracking viraler Nukleinsäuren und Proteine in der Zelle sowie die Untersuchung der Interaktion zwischen Virus- und Wirtszellen, der Zellviabilität und des Metabolismus.

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PCR und serologische Tests

Die Entwicklung und Implementierung von präzisen molekularen und serologischen Assays ist ein wichtiger Schwerpunkt vieler Labore weltweit. Promega bietet Produkte und kundenspezifische Lösungen für Labore an, die PCR-basierte molekulare Tests entwerfen, durchführen und normieren und unterstützt Labore, die serologische Assays durchführen und neue serologische Testmethoden erforschen.

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